（一）地理位置
阿蓮區位於高雄平原東北端，東經120度19分23秒，北緯22度53分03秒附近，坐落高雄市治西部的北端，區境位於二仁溪與阿公店溪之間，東隔大崗山與田寮區為界，西與路竹區接壤，北以二仁溪與台南市關廟區、歸仁區為界，南與岡山區接壤。
（二）氣候水文
阿蓮區位於臺灣西南部，在北迴歸線以南，屬於熱帶季風氣候區，冬季涼爽乾燥，夏季炎熱多雨，春秋兩季均甚短暫。臺灣本島由於位在亞洲大陸和太平洋的接觸帶上，季風盛行，氣候受季風的影響很大。夏季盛行西南季風，從5月上旬到9月下旬，為期約4個月，但帶著大量的水氣，使在此期間內臺灣南部和西南部降雨的機會大增，是1年中降雨較多的時期，也是重要的雨季。在冬季吹東北季風，臺灣東北部和北部地區的雨季，西南部地區的阿蓮則無法受此雨的潤澤而形成乾季，常有缺水的現象產生。
阿蓮雖位於高雄市境內，但離臺南氣象局觀測站反而比高雄觀測站近，故在此將兩地之觀測記錄同時列入參考比較。阿蓮年平均溫約25度，年溫差相當大，夏季溫度最高可達約36度，冬季氣溫寒流來襲則最低約7度，上下高達29度之多。降雨量約1670公釐（台南、高雄兩地之平均），可謂不少，只是大致集中於每年的4月到9月，其餘月份的雨量相當稀少。從全年的降雨日數來看，降雨的日數並不多，而且相當的不平均，尤其颱風季節來臨，單日的雨量最高可達300多公釐。
颱風是臺灣的天然災害之一，根據氣象局的統計，西元1897年至1996年的100年間，臺灣地區一共遭受348次颱風的侵襲，每年平均有3.5個侵臺颱風，而且大都集中在7至9月間，雖然說氣象局都能預測颱風的動態，呼籲民眾做好防颱準備，每次隨颱風而來的暴風，豪雨及浪潮，多少都會造成民眾財物甚至生命的損失。
（三）山川河流
大崗山
大崗山是從平原突起的一座台地狀的方山，是阿蓮唯一較高的地方。大崗山南北長約4公里，東西寬度不到2公里，西南部海拔最高達312公尺，山頂的平台面由西向東緩緩傾斜約8°。山的西側是高約30公尺到50公尺的直壁狀陡崖，向南北延長，山的東側也呈30公尺的石灰岩陡崖，陡崖的下方露出青灰岩。
大崗山是隆起的珊瑚礁石灰岩，是臺灣本島少數擁有如此地形的地區，由於石灰岩岩質疏鬆多孔，雨水下滲容易，因此地表幾無溪流形成，且地表的珊瑚礁石灰岩因為溶蝕作用的原因，表面呈現許多窪洞溝槽，崎嶇難行，有時形成較大的狹長岩溝，構成一線天之類的小地形，有時形成具有淺凹之石灰阱（Doline），或灰岩殘丘，整個山形表面並不是很平整。
大崗山的地層岩性可分為：
- 臺地堆積物：大崗山的山頂部份主要由30公分以下之圓礫、沙及黏土組成，因曾受紅土化作用而呈紅褐色，與其下的石灰岩層呈不整合的關係。
- 山麓堆積物：本層由高斷崖之岩層崩落堆積而成，分佈於大崗山的四周，其主要成分為大塊之石灰岩礫、泥沙及土壤，偶有紅土滲雜其中，其下界與上新世岩層以不整合相接。
- 大崗山石灰岩層：大崗山的石灰岩層平均厚度約在40公尺，主要由生物碎屑所組成的岩礁構成，其中以珊瑚礁為最多，在北段大崗山的崗山頭地區，以生物細小碎屑及二枚貝、掘足類和有孔蟲化石為主；中部的石灰岩，以底棲固著性生活的生物為主，大致有石灰質藻、鈣質海綿、苔蘚蟲，及一些珊瑚、貝類碎屑與有孔蟲化石等所組成；南段石灰岩，始有群體珊瑚出現，屬真正珊瑚礁石灰岩。石灰岩層下段接近泥岩之部分呈現相當多的孔隙，由於泥岩層為不透水層，故地下水積聚於石灰岩與泥岩交界面處。
- 泥岩層：大崗山的泥岩厚度約550公尺，屬分佈於臺灣西南部的上部古亭坑層。其泥岩分為兩部分，其下部分為甚純的暗灰色泥岩，為大崗山石灰石底盤之基岩；其上部份為呈灰白色之鈣質泥岩，內含相當多之生物碎屑與化石，其位置介於石灰岩與暗灰色泥岩之間，是兩者之間的過渡地帶，厚度可由數十公分到數公尺，稱之為泥灰岩。
二仁溪
二仁溪原名「二層行溪」，民國49（1960）年經臺灣省政府公佈核定改名為二仁溪，發源於高雄市內門區木柵里山豬湖，是高雄市、台南市的界河，流經高雄市內門、田寮、阿蓮、湖內、茄萣等區，及台南市龍崎、關廟、歸仁、仁德等區與台南市灣裡，在茄萣區白砂崙附近流入臺灣海峽，全長62.2公里，平均比降是1：142，是本省緩降河川之一。
二仁溪為南台灣主要河川，沿岸自然生態保持原始風貌，鳥類成群、燕巢泥洞繁多，魚群於水生植物旁嬉戲，動植物皆在生態保育下自然的棲息繁衍。